En el caso de una isla las únicas maneras de llegar a San Miguel son el avión o barco. El aeropuerto internacional de Ponta Delgada (João Paulo II) es servido por varias conexiones diarias con la parte continental de Portugal y ofrece vuelos regulares con Boston y Toronto y los principales aeropuertos europeos. Aún cuentan con varios enlaces diarios entre las islas.

Las conexiones regulares en barco en el muelle de cruceros de puertos marítimos están aseguradas sólo desde mayo a septiembre con conexión a otras islas de las Azores varias veces por semana.